Никита Балахонцев родился 1 октября 2002 года в Хабаровске, воспитанник футбольного клуба СКА. Выступает на позиции крайнего полузащитника.
Зимой 2020 года Никита перешёл из родного клуба в новотроицкую «Носту», но так и не дебютировал за уральский клуб из-за пандемии коронавируса.